北京交通大学目前拥有一级学科硕士点34个：

应用经济学、法学、马克思主义理论、外国语言文学、新闻传播学、数学、物理学、生物学、系统科学、统计学、力学、机械工程、光学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、化学工程与技术、地质资源与地质工程、交通运输工程、环境科学与工程、城乡规划学、软件工程、安全科学与工程、生物医学工程、管理科学与工程、工商管理、公共管理、设计学。