北京应该是高校最多的城市吧，南京也不少，只能智能列举部分了。

北京有66所本科大学：清华、北大，中国人民大学、北京航空航天大学，北京师范大学，北京外国语大学，中国农业大学，中国科学院大学，中央财经大学，对外经济贸易大学，北京理工大学，北京工业大学，中国传媒大学，北京交通大学，中央戏剧学院，中央美术学院等等等等。南京的本科学校有34所：南京大学，东南大学，南京航空航天大学，南京师范大学，河海大学，南京师范大学，南京财经大学，南京理工大学，河海大学，南京信息工程大学，南京医科大学等等