首都师范大学附属房山小学的前身是北京送变电公司子弟学校，属于企业办学。

学校于2005年左右变为公立中学，进而更名为“首都师范大学附属良乡实验学校”；2007年划转地方，成为隶属房山区教委的一所公办十二年一贯制学校，2009年，与电业中学小学部合并，成为一所区教委直属小学，2006届毕业之后，正式取消中学部。

2012年，更名为北京市房山区良乡第五小学。

2016年，更名为首都师范大学附属房山小学。

2020年5月，入选北京市中小学科技教育示范学校名单。