生物医学工程专业的就业前景很好，毕业生的主要就业方向为管理机构和国家机关、医学机构、国际制药、保健品企业等。

生物医学工程专业学生就业的主要去向为研究机构，医院影像、设备、临床工程、信息中心等相关科室，医疗器械相关企业、事业单位，政府相关管理部门等。毕业生工作去向主要有以下几个方向：医院，到医院设备科，放射科，信息中心等部门工作，主要从事医疗器械的维护、采购管理工作以及信息管理等；医疗器械企业，到医疗仪器企业做研发、销售、维修。销售主要是做好本区域内老客户的器械更新等业务，同时需要开发新的销售渠道；售后工程师，主要负责所属器械的安装调试维修等。医疗器械企业南方发展普遍较好，企业多，就业机会多；电子计算机相关企业。生物医学工程专业所学知识面广，包括很多电子计算机方面的课程，很多毕业生进入此类企业工作；高等医学院校从事医学影像技术的教学、科研工作；报考相关方向的公务员；除此之外，应征入伍、参加支援西部计划、到村任职、报考选调生、自主创业等就业途径。