清华大学从20世纪20年代起开始培养研究生，至1965年共培养了研究生近千名。

自1981年国家建立学位制度至2021年底，学校共授予硕士和博士学位143910人（含北京协和医学院-清华大学医学部16352人），其中博士学位34303人（含北京协和医学院-清华大学医学部9089人），硕士学位109607人（含北京协和医学院-清华大学医学部7263人） 。现有在学研究生40962（含北京协和医学院-清华大学医学部5939人），其中博士生19375（含北京协和医学院-清华大学医学部3380人），硕士生21587（含北京协和医学院-清华大学医学部2559人）。