1、在通用税务数据采集软件(这个软件一般在税务局的网站下载即可)里输入所取得的海关增值税票的信息2、输入完毕后按系统提示申报并将信息存入到U盘(会生成两个文件,一个是扩展名为JK,一个为CRC)将U盘的信息和纸质的税票交给税务局,或者按当地税务局的要求,自传到所属税务局的网上3、一般申报抵扣税款的委托进口单位,必须提供相应的海关代征增值税专用缴款书原件,委托代理合同及付款凭证，给主管税务官员核查、备案。

否则，不予抵扣进项税款。对海关代征进口环节增值税开据的增值税专用缴款书上标明有两个单位名称，即既有代理进口单位名称，又有委托进口单位名称的，只准予其中取得专用缴款书原件的一个单位抵扣税款。扩展资料:取得增值税专用发票的一方持发票抵扣联到主管税务机关，在税务机关的扫描仪上扫描，计算机读取票面上的密文，与票面上的七项数据（发票代码、发票号、开票日期、购纳税人识别号、销方纳税人识别号、金额、税额）进行比对，比对一致后，将数据传入国家税务总局的增值税发票比对系统数据库。数据将在那等待90天，等待销售方抄报税的数据资料并与之进行比对。比对一致则通过；不一致或没有相对应的发票数据可比对，则自动将该信息转到未通过的数据库中。税务稽查就会根据转来的认证发票上的信息找到开出和取得发票的双方，查实原因并做出相应的处罚。认证过的专用发票，是企业项抵扣的依据。如果你单位也开展网上认证，那么，可随时在网上进行认证；如果没有，一般是在月末集中到主管税务机关认证。抄税是金税工程下的一个程序，就是指将本企业本月开出的增值税发票的七项数据信息写入IC卡。报税是指企业持存有开出的增值税发票七项信息的IC卡及相关纸质材料送到税务机关去，读入税务机关的电脑中，上传到国家税务总局的增值税发票比对系统数据库中。