燕京大学，司徒雷登任校长，曾与哈佛大学合作成立哈佛-燕京学社，国内外名声大噪。

辅仁大学,1925年由罗马教廷创，20世纪初与北大、清华、燕京并称北平四大名校，驰名海内外。齐鲁大学(山东基督教共和大学)，为1904年至1952年山东省教会大学，由来自美国、英国以及加拿大的14个基督教教会组织联合开。号称“华北第一学府”，与燕京大学齐名，有“南齐北燕”之称。东吴大学，20世纪初中国第一所民大学。1900年由基督教监理会在中国苏州创,是中国第一所西式大学。圣约翰大学，中国首个全英语授课的大学，有“东方哈佛”和“外交人才养成所”之称，创下了 教育多项第一，体育教育更是遥遥领先。（林语堂、张爱玲、邹韬奋、顾维钧、宋子文、荣毅仁、刘鸿生、贝聿铭、施肇基等一大批影响中国历史的杰出人物出自该校）。震旦大学，著名教会大学，中国近代著名高校。由中国神e68a84e8a2ade79fa5e9819331333363373732父马相伯于1903年创。金陵大学，美国基督教会在南京创的教会大学。教育家陶行知、诺贝尔文学奖获得者赛珍珠、哲学家方东美、文学史家程千帆等著名校友均出自于此。在美国加利福尼亚大学对外人在华所大学编类中，金陵大学是教会大学中唯一的A类，持有金陵大学学位的毕业生有资格直接进入美国大学的研究生院,是当时社会评价为“中国最好的教会大学”，享有“江东之雄”、“钟山之英”之美誉。国立中央大学， 第一学府（48年就已领先日本东京帝国大学，排名亚洲第一）国立交通大学，钱学森、杨嘉墀、陈能宽、姚桐斌；田炳耕（美国科学院院士）；周文德、谢承德、王安、赵佩之、吴耀祖、郑显基、李天和、葛守仁、Rong-yuWan、姚熹、锁志刚、茅以升、林同炎、林同骅(美国工程院院士14位),还有众多中科院院士均出自于国立交大。其余如之江大学、岭南大学，比上述9所大学世界知名度、影响力都要小很多