学林街11幢11号附近杭州师范大学临床医学院前身是浙江医科大学杭州分校临床医学系，1979年建立，1993年更名为杭州医学高等专科学校临床医学部，2001年更名为杭州师范大学医学院临床医学系，2004年杭州师范大学成立临床医学院，附属医院（杭州市第二人民医院）更名为杭州师范大学附属医院。

2013年与杭州师范大学护理学院、杭州师范大学健康管理学院（原医药卫生管理学院）、杭州师范大学基础医学部三院一部合并为杭州师范大学医学院。