星网创新研究院和系统院是两个不同的机构，它们之间存在着明显的差异。

1. 星网创新研究院是一个独立的机构，从事的是技术咨询和解决方案的提供，主要面向互联网领域，包括电子商务、社交、游戏等多个方面；2. 而系统院则是一种大学设置的院系架构，负责教学、培训和研究开发。系统院主要培养的是与计算机系统、软件、网络、数据库等相关的 IT 专业人才。

3. 两个机构在职能、任务以及面向的对象上都存在很大的差异。因此，星网创新研究院和系统院的区别显而易见。