没有什么区别，只是一些院，系分布不同而已。

沙河校区位于北京市昌平沙河高教园区，距校本部26公里，占地面积97万平方米，为1458亩，规划建筑面积为62万平方米。在规划功能分区上，分别有学生生活区、文体活动区、教学实验区、后勤基础保障区、国家实验室和专家公寓区等几个方面。

北京航空航天大学本部是以研究生部和一些重要的专业学科为主的校区及总部，沙河校区主要是本科生为主的校区，另外许多专业和实验基地也在那里。