区别就是北京是本部，珠海分校。以前珠海校区属于北师大的二级学院，属于二本，从前两年开始北师北京本部收回管理权，从二本学院提高为一本，和北京本校的录取分数一致，毕业证也和北京本部一样，类似中山大学珠海校区。主要人事管理权，师资的配备也有北京本校调配。

北京师范大学的珠海校区和北京校区是有很大区别的。北京校区是985和211国家重点支持高等院校，其教育学等学科是全国手掘一指的，并且占地面积也很大。而珠海校区只是北京师范大学的一校区，只有几个专业的普通高校，即不是985也不是211。