综合实力排名的话，中国科技大学肯定比北京交通大学要好。

中科大是中央直管副部级建制，由中国科学院、教育部和安徽省三方共建；位列世界一流大学建设高校、985工程、211工程，入选珠峰计划、强基计划、111计划等。北京交通大学，由教育部、交通运输部、北京市人民政府、中国国家铁路集团有限公司共建，位列“211工程”“985工程优势学科创新平台”“世界一流学科建设高校”。