北京通州区主要有五所大学：

1、北京物资学院北京物资学院（Beijing Wuzi University）是一所以物流和流通为特色，以经济学科为基础，以管理学科为主干，经、管、理、工、文、法等多学科协调发展的公办普通高等院校。

2、北京工业大学通州分校北京工业大学通州分校是通州区政府和北京工业大学联合创办的大学分校。自创建以来，学校坚持“团结、勤奋、严谨、创新”的校风，以“为首都经济建设服务，注重人才的培养，规模不断扩大，在软硬件方面为莘莘学子创造良好条件。

3、国家法官学院国家法官学院是最高人民法院的直属事业性单位，成立于1997年，其前身是1985年成立的全国法院干部业余法律大学和1988年成立的中国高级法官培训中心。其主要任务和职责是对中国高级人民法院、中级人民法院的院长、副院长、各级法院的高级法官及其后备人才进行任职、续职、晋级资格培训和审判业务专项培训，对预备法官进行岗前培训。

4、北京现代音乐研修学院北京现代音乐研修学院（即北京现代音乐学院）简称：北音，民办非学历教育机构 。现代音乐为主教学的首都艺术学府，教学师资力量雄厚，目前正准备向着国际化的教学方针前进。

5、北京政法职业学院北京政法职业学院是经北京市人民政府批准、教育部备案的全日制高等职业院校。