微生物感染可能是由于本来不在体内的微生物（细菌，支原体等）进入体内并占据优势，而使得人察觉到不适引发感染。

还有一种可能是由于人体抵抗力下降，本来栖息在人体阴道内的势均力敌的起到屏障作用的正常菌群（各种微生物相互制约，共同生存，反而可以防止感染）变成菌群失调，某一种微生物占据了优势，而引起人体的感染。