文峰校区(原南通工学院)

公共卫生学院 地理科学学院 纺织服装学院（4年级） 化学化工学院(4年级) 杏林学院（化工/纺织类专业4年级）

医学院 神经科学系 航海医学系 护理学院 杏林学院（医科类非1年级）

钟秀校区(原南通师范学院)

主校区（新校区）

法政学院 商学院 公共管理学院 机械工程学院 电子信息学院 电气工程学院 计算机科学与技术学院 建筑工程学院 纺织服装学院 外国语学院 化学化工学院 杏林学院（工科类4年级） 文学院