东京大学的校徽是2004年在旧校徽的基础上修改而成的，主体依旧沿用的之前两片银杏叶的形态，细节上存在略微的不同。

较大的差别在于颜色的应用，一片叶子用了银杏黄，另一片则用了淡蓝色。旧校徽是1948年由东京大学第二工学部教授星野昌一设计的，「大学」的文字用的是金色，而银杏部分用的是银色。东京大学校训：以质取胜、以质取量、培养国家领导人和各阶层中坚力量。与一般校徽的出发点不同，东大的校徽设计走的是意象派。