北京林业大学共有26个一级学科硕士学位授权点、1个二级学科硕士学位授权点、12个专业硕士学位类别。

涵盖工学（机械制造及其自动化，机械电子工程，机械设计和理论，车间工程，车辆控制及理论，林产化学加工工程，环境工程等16个学科），经济学（金融学，国际贸易学等3个），教育学（应用心理学1个），哲学（科学技术哲学1个），管理学（会计学，企业管理等6个），理学（微生物学，植物学等7个），农学（土壤学等14个），还有文学，大学等学科。