主要体现在以下几个方面：

1. 爱国心和动机不同：康熙御驾亲征是为了维护祖国领土完整和对准噶尔部进行惩罚，表现了康熙皇帝强烈的爱国心与维护国家利益的决心；而朱棣南巡是为了巩固自己的地位和打压反对派势力，动机较为复杂。

2. 消耗资源不同：康熙御驾亲征历时多年，耗费大量人力物力财力，但也带来了一定的战争收益，为维护国家尊严和安全产生了积极影响；而朱棣南巡则大量动用军备与人力资源，造成了很大的民族损失和经济损失。

3. 影响与追溯不同：康熙御驾亲征被认为是清朝盛世的一个象征，他在战争中所表现出来的能力也被后人所称道；而朱棣南巡则被认为是明朝灭亡的一种标志，南巡后国家财政状况与社会治安有所动摇，随后的历史也摇摆不定。