部分校区在市中心。
东京大学一共有十五个校区,数量是十分惊人的。本乡总校区:东京都文京区40.27公顷浅野校区:东京都文京区4.37公顷弥生校区:东京都文京区11.28公顷理学系研究科附属植物园:东京都文京区16.08公顷驹场校区:东京都目黑区35.20公顷教育学部附属中等教育学校、海洋研究所:东京都中野区4.87公顷白金校区:东京都港区7.2公顷农学生命科学研究科附属农场:东京都西东京市31.36公顷三鹰校区:东京都三鹰市6.88公顷农学生命研究科附属牧场:茨城县西茨城郡36.12公顷物性研究所、宇宙线研究所、新领域创成科学研究科:千叶县柏市23.75公顷检见川校区:千叶县千叶市32.3公顷农学生命科学研究科附属农场二宫果树园:神奈川县中郡3.93公顷医科学研究所附属奄美病害动物研究设施:鹿儿岛县大岛郡0.88公顷农学生命科学研究科附属爱知演习林:爱知县濑户市1264.63公顷