三方协议是指由三方签署的协议，其中的签证部门指的是对于该协议需要签证的部门或机构。

在国际贸易中，如果涉及到跨国合作，往往需要签署三方协议，其中的签证部门可以是国家政府的相关部门，如外交部、商务部等，也可能是专门的国际组织或签证中心。签证部门的存在，可以确保协议的合法性和实施的有效性，同时也能保护各方的权益和利益。因此，在签署三方协议时，签证部门的角色是非常重要的，必须要在协议制定过程中充分考虑到其职责和作用。