重庆大学强基计划数学与应用数学专业采用“3+1+2”（本-硕贯通）和“3+1+4”（本-博贯通）模式进行培养。

其中，“3”是前三年主要以数学学科课程为主，兼顾物理力学基础；“1”是第四年学生根据自己的兴趣和特长进入国家重大战略需求的相关领域方向，完成本硕博衔接课程学习，“2”和“4”分别指进入硕士或博士研究生阶段，开展领域方向的科学研究工作。