上海交通大学现有五个学科：分别为生物学、机械工程、船舶与海洋工程、临床医学、工商管理，排名居第一档（A+档，前2%）学校有18个学科入选国家“双一流”建设学科；17个学科入选上海市高峰高原学科。

在第四轮学科评估中，全校共有25个学科入选A类。