南京大学毓琇书院是一个面向新工科建设的书院，包含了工科试验班和电子信息类两个大类新生。

经过一年的书院教育后，学生将参加分流，去往不同的院系和专业。南京大学毓琇书院中“毓琇”二字得名于中国电机、无线电和航空教育的奠基人之一、中国近代史上杰出的文理大师顾毓琇先生。