1、身份不同。
博士(以及硕士、学士)是以学生的身份在校学习、取得合格成绩并通过论文答辩后所获得学位的称谓。博士在拿到博士学位证书后为了进一步深入进行学术研究可申请进入博士后流动站。国家在大学建立博士后流动站在物质设备上和研究环境上都给予了很好的条件支持，进入博士后流动站的研究人员必须经过严格的筛选后才能成为博士后。博士后以在校教师的身份从事课题研究并且享受教师相应的待遇。
2、博士后和导师的关系与博士生和导师的关系不同。博士生与其选定教授的关系是师生关系，其研究方向须经导师的肯定并由导师来评判修改其博士论文，博士生由学校发给部分生活补贴，没有正式的工资收入；博士后与选定教授的关系是合作关系，博士后是所在大学或研究机构的正式工作人员，享受一定标准的工资待遇。所以博士后并不靠合作导师的科研项目来生活，参与项目所应该得的报酬是奖金而非工资。
3、博士后研究领域必须是跨学科的。博士后一级学科不能与博士期间一级学科相同，即不能停留在原来的领域再继续研究，而应在一个新的领域展开研究，其难度之大是可想而知。因此，说博士后是一种跨学科的复合人都并不为过。此外在待遇方面：博士后人员档案关系在国家人事部备案，出站后可在全国自由流动，国家对此给予特殊优惠政策;而博士则无此待遇。
