伊犁师范大学1980年5月7日，经国务院批准，将伊犁师范学校升格为全日制普通本科院校，定名为伊犁师范学院，办学规模为1200人，设置中文、外语、体育、数学、物理、化学等8个专业。

1987年，经国务院学位委员会批准，学院成为学士学位授权单位。

2002年，学校顺利通过教育部本科教学合格评估。

2003年，经自治区批准，伊犁教育学院整体并入伊犁师范学院。

2006年，经国务院学位委员会批准成为硕士学位授权单位。

2007年，学校本科教学工作水平评估获得优秀。

2012年2月，经自治区人民政府批准，奎屯校区独立设置为新疆应用职业技术学院。

2015年11月，江苏省人民政府、新疆维吾尔自治区人民政府和教育部决定共建南京师范大学和伊犁师范学院。

2017年，学校入选教育部首批“高校数字媒体产教融合创新应用示范基地”项目合作院校。伊犁师范大学2018年12月，经教育部批准伊犁师范学院更名为伊犁师范大学。截至2019年1月，学校设有人文分院、数学与统计分院、中国语言分院、物理科学与技术分院、电子与信息工程分院、化学与环境科学学院、生物与地理科学学院、外国语学院、马克思主义学院、法学分院、体育分院、艺术分院、教育科学学院等13个学院，开设49个本科专业，涉及文学、理学、教育学、工学、历史学、法学、艺术学、管理学、经济学和农学10个学科门类。