复旦大学图书馆是国家古籍重点保护单位，中国高校图书情报工作指导委员会副主任委员馆，中国高校人文社会科学文献中心（CASHL）两个全国中心馆之一。
设有教育部面向全国和华东地区的外国教材中心，教育部文科外文图书引进中心书库、欧盟图书专架、教育部科技查新工作站（综合类）、上海市科委科技查新站（计算机与生物）、全国医学文献检索教学研究会理事长馆兼秘书处、图书馆学硕士培养点、中国索引学会秘书处，并承担了《中国索引》和《上海高校图书情报工作研究》两份杂志的编辑出版工作。 1918年由学生集资购书成立的戊午阅书社是复旦大学图书馆的前身。复旦大学图书馆现由文科馆、理科馆、医科馆、张江馆、江湾馆（李兆基图书馆）、古籍部（国家古籍重点保护单位）组成。
2000年4月27日，上海医科大学与复旦大学合并，原上海医科大学图书馆改为"复旦大学图书馆医科馆"。
