马来西亚理科大学是国内教育部认可的马来西亚公立大学之一，学生可以在教育涉外监管网上查询学校的资质。

马来西亚理科大学是马来西亚顶尖的研究型大学之一，以医学、理学、工程学最为突出，是马来西亚最具领先地位的大学之一，致力于成为世界级一流的高等学府。从录取难度、社会声誉、学校地位等角度，马来西亚理科大学被公认为是大马国内排名第二的老牌名校。因此，马来西亚理科大学的国内认可度较高。