东京大学可以延长1年左右的时间毕业，每年的毕业时间在3月份和9月份二个时间的，东京大学本科一般4年，医学、农学、兽医学及药学系的药学科学专业学制6年。

东京大学本科教育实行弹性学制，前两年为本科的前期课程，集中在教养学院进行，后几年分流到各学院进行学科专业教育。