毕业生档案在户籍所在地的保存方式主要是通过学校或者人才市场进行保存。

如果毕业生在毕业时没有对档案进行托管，那么档案会由学校保存两年，之后会转到户籍所在地的人才市场。如果毕业生想把档案存放在学校，可以在毕业的时候办理好档案的托管，并注意好学校保管档案的期限。如果毕业生想把档案保管在单位，那么需要单位有接收个人档案的资质，并且在签订就业协议后，档案会被发往工作单位。如果毕业生想把档案存放在户籍地的人才市场，那么首先需要在人才市场申请调档函，然后再去原来的档案存放单位申请调档，最后再保管在现在的人才市场。总的来说，保存毕业生档案的方式有多种，具体选择哪种方式需要根据毕业生的具体情况和需求来决定。