EM菌是 Effective Microorganisms 的英文缩写，中文意思是有效微生物菌群。

它是由功能各异的多种微生物组成的一种活菌制剂，对土壤恶化、连作障碍、作物的抗病抗逆能力、产量和品质等有着积极的作用。EM菌的菌类成分及主要功能EM菌是由光合菌群、乳酸菌群、酵母菌群、放线菌群、丝状菌群等10属80余种微生物组成的生物制剂。光合菌群①以土壤接受的光和热为能源，将土壤中硫氢和碳氢化合物中的氢分离出来，变有害物质为无害物质。

②以植物根部的分泌物、土壤中的有机物、有害气体(硫化氢等)及二氧化碳、氮等为基质，合成糖类、氨基酸类、维生素类、氮素化合物、抗病毒物质和生理活性物质等，是肥沃土壤和促进动植物生长的主要力量。

③光合菌群的代谢物质可以被植物直接吸收，还可以成为其他有益微生物繁殖的养分。乳酸菌群①靠摄取光合细菌、酵母菌产生的糖类形成乳酸。乳酸具有很强的杀菌能力，能有效抑制有害微生物的活动和有机物的急剧腐败分解。

②能够分解在常态下不易分解的木质素和纤维素，并使有机物发酵分解。

③能够抑制连作障碍产生的致病菌增殖。酵母菌群①利用植物根部产生的分泌物 、光合菌合成的氨基酸、糖类及其他有机物质产生发酵力， 合成促进根系生长及细胞分裂的活性物质。

②给可促进其他有效微生物(如乳酸菌、放线菌)增殖所需要的基质，提供重要的给养保障。

③产生的单细胞蛋白是动物不可缺少的养分。放线菌群①从光合细菌中获取氨基酸、氮素等作为基质，产生出各种抗生物质、维生素及酶，可以直接抑制病原菌。

②提前获取有害病菌增殖所需要的基质，从而抑制它们的增殖，并创造出其他有益微生物增殖的生存环境。

③对难分解的木质素、纤维素、甲壳素等具有降解作用，并容易被动植物吸收， 增强动植物对各种病害的抵抗力和免疫力。

④促进固氮菌和VA菌增殖。 固氮菌是细菌的一科，能固定空气中的氮素。VA菌是最常见的一种和植物根系共生互惠的微生物，为作物提供多种矿质营养(尤其是磷)，同时也从作物中获得自身所需的光合产物，在植物营养、养分循环、土壤改良等方面都具有非常重要的意义。