区别之一就是发证单位不一样，范围比免疫证明更加广泛。

动物检疫合格证明是由动物卫生监督机构官方兽医按照《中华人民共和国动物防疫法》和《动物检疫管理办法》的规定对动物、动物产品实施检疫出具的，标示某一动物及其产品检疫合格的证明。宠物免疫证明一般是需要去正规的宠物医院或者是动物防疫站来进行办理的，给宠物注射疫苗也是很重要的。顺利开出动物检疫证明的前提是动物临床检查无异和其正规的免疫证明。也就是说只有提供了自家宠物的免疫证才能开出检疫证。