两者的权利和义务不同。永久居住权是指有在某地居住的权利，但是没有选举权和被选举权，而入籍以后，就会有选举权和被选举权了。当然所尽义务也会有很大区别的。

永久居住是因为各种原因在爱尔兰长期居住，但不具有爱尔兰国籍，本质还是外籍人士。入籍是抛弃原有国籍，正式加入爱尔兰国籍享有爱尔兰公民的各项权益，不再享受原国家的各项权益。就如华侨和华裔的区别。