杭州市民可以在各区县医院或者市级医院的医务部门办理健康证。

其中，市民可以前往杭州市中心病房（位于杭州市西湖区南山路1号）或者各区县的卫生局（或者医院）咨询具体的流程和所需材料。延伸：除了前往医院的医务部门办理健康证外，市民也可以使用手机APP“e健康”进行线上预约和办理。另外，需要注意的是，不同的健康证对应的费用也不同，市民在前往办理的时候需要咨询清楚。