黄鳍金枪鱼广泛分布于各大洋热带、亚热带海域中，唯地中海未见分布。

在中国，南海和东海以及台湾沿海有产。具体分布于美属萨摩亚、安哥拉、安圭拉、安提瓜和巴布达、阿鲁巴、澳大利亚、巴哈马、孟加拉国、巴巴多斯、伯利兹、贝宁、百慕大、博内尔、圣尤斯特歇斯和萨巴、巴西、文莱达鲁萨兰国、佛得角、喀麦隆、开曼群岛、智利、科科斯群岛、哥伦比亚、科摩罗、刚果、库克群岛、哥斯达黎加、古巴、库拉索、象牙海岸、吉布提、多米尼加共和国、厄瓜多尔、萨尔瓦多、赤道几内亚、斐济、法属圭亚那、法属波利尼西亚、加蓬、冈比亚、加纳、格林纳达、瓜德罗普、关岛、危地马拉、几内亚、几内亚比绍…………。