首先厦门大学本身就不存在主校区不主校区的说法，厦大现在两个校区，一个是思明校区，一般称之为老校区，部分人会叫本部校区。

另一个是翔安校区，是新校区。目前录取在生命科学学院、海洋与地球学院、环境与生态学院、医学院、药学院、公共卫生学院和能源学院的新生和国际学院爱尔兰都柏林项目的新生入住翔安校区，其它学院新生入住思明校区。