学校由 中华人民共和国教育部 于1982年创办， 联合国儿童基金会 予以资助支持，初名“南京特殊教育师范学校”，隶属中华人民共和国教育部管理；1997年学校划归 江苏省人民政府 管理；2002年升格为专科院校，更名为“南京特殊教育职业技术学院”；2009年成为 中国残疾人联合会 和江苏省人民政府共建单位；2015年正式获批升格为普通本科高校。