限制出境由公安机关执行。

根据《中华人民共和国出境入境管理法》规定，公安机关负责对涉嫌犯罪、违法行为或其他需要限制出境的人员进行出境限制。公安机关会根据相关法律法规和具体情况，对个人进行出境限制，并在出入境边防检查站进行登记和监控，确保出境限制的执行。