用处不同。

出入境通行证：出入境通行证是公民从事边境贸易、边境旅游服务或者参加边境旅游等情形下可申请的出入境通行证件。

护照：护照是一个国家的公民出入本国国境和到国外旅行或居留时， 由本国发给的一种证明该公民国籍和身份的合法证件。 护照（Passport）一词在英文中是口岸通行证的意思。也就是说， 护照是公民旅行通过各国国际口岸的一种通行证明。

办理方式不同。

出入境通行证：公民从事边境贸易、边境旅游服务或者参加边境旅游等情形，可以向公安部委托的县级以上地方人民政府公安机关出入境管理机构申请中华人民共和国出入境通行证。

护照：申请人居民身份证、户口簿及复印件;在居民身份证领取、换领、补领期间，可以提交临时居民身份证。

期限不同。

出入境通行证：证件最初发给因国籍冲突不便持有护照的人员入国或出国时使用，在出境或入境时收回。

护照：护照申请后，长期有效。

1、港澳通行证跟护照同属于国家出入境证件，而最大的区别则是目的地不同。

2、港澳通行证的目的地主要是香港以及澳门这两个特别行政区；而护照的目的地则是第三国家。

3、港澳通行证则是国内的居民因私往来香港或澳门特别行政区旅游、探亲、从事商务、培训、就业等非公务活动时所用。在办理港澳通行证的时候一般会签注，可以自己选择一年几次。

4、港澳通行证(自由行)享有的主要优势：

可以单独出发，用个人身份，在有效签注时间内根据签注条件自由往返签注指定地区，所以叫自由行；

5、没开通自由行地区的赴港澳的通行证：

A、L签注--就是跟户口所在地组织的旅行团，集中办理证件、证件除了出入海关，也是集中管理，集中出入，不可以单独出入海关。旅行社一般都有为每个人做了担保的，如出了问题，他们要被公安请去喝茶的。当然也有自己单独到了某海关，自己找团一起出境的，那要化跟团的银子的，也是一个办法。

B、商务签注--具备申请港澳商务签注资格的公司(详细条件公安局有规定)出面申请(其实也是担保)，可为该公司员工办理商务签注，这个可以户口在哪里没有关系，只要公司愿意为你申请就可以。