一般情况下，如果有合法的邀请函，海关不会将其劝返。

但是，如果邀请函没有得到签证机关的认可，或者申请人的签证手续不完备，或者存在其他移民管理机关认为不合理的因素，海关可能会拒绝签证申请或者采取其他措施。因此，在申请签证时，务必按照相关规定和要求准备好所有必要的申请材料，并确保申请内容的真实性和准确性，以避免出现不必要的麻烦。