一、用处不同1、出入境通行证：出入境通行证是公民从事边境贸易、边境旅游服务或者参加边境旅游等情形下可申请的出入境通行证件。

2、护照：护照是一个国家的公民出入本国国境和到国外旅行或居留时， 由本国发给的一种证明该公民国籍和身份的合法证件。护照（Passport）一词在英文中是口岸通行证的意思。也就是说， 护照是公民旅行通过各国国际口岸的一种通行证明。

二、办理方式不同1、出入境通行证：公民从事边境贸易、边境旅游服务或者参加边境旅游等情形，可以向公安部委托的县级以上地方人民政府公安机关出入境管理机构申请中华人民共和国出入境通行证。

2、护照：申请人居民身份证、户口簿及复印件;在居民身份证领取、换领、补领期间，可以提交临时居民身份证。未满16周岁的居民携带本人户口簿（集体户口提交《常住人口登记表》）、其监护人居民身份证原件以及能证明监护关系材料的原件（如户口簿、出生证等），并由其监护人陪同前往办理。

三、期限不同1、出入境通行证：证件最初发给因国籍冲突不便持有护照的人员入国或出国时使用，在出境或入境时收回。

2、护照：护照申请后，长期有效。