主要有两种方式来确定加拿大体检的合格不合格：

一是医生的诊断报告，

二是移民部公布的体检标准。

医生会根据移民部公布的体检标准对申请人进行全面检查，并填写诊断报告，报告中会注明体检结果和医生的建议。如果在体检过程中存在不符合移民部要求的疾病或身体条件，医生会在报告中作出相应的标注，根据标准判断是否合格。另外，加拿大移民部也会按照自身制定的标准对医生的报告进行审核，从而确定体检合格不合格。因此，只有通过医生的体检并符合移民部的标准才能最终被认定为体检合格。