反恐专业的学生主要学习的课程包括恐怖主义概论、恐怖组织研究、反恐国际合作、反恐情报、反恐专案侦查、涉恐安全风险评估、网络犯罪侦查与取证、处恐战术与指挥。

对于反恐专业的学生来说，除了理论教学，还包括实践，比如针对具体涉恐案件如何进行指挥、布置战术等。在学校的教学体系中还安排了实训课程，会尽可能帮助学生应用课堂学到的知识去解决实际问题。