普通生和指标生的区别在于，普通生是对学校招生计划的补充，学校的录取方式是以志愿为顺序，以分数为依据，择优录取，招满为止。

而指标生，是指高中学校给予各初中学校的招生指标，即在各初中学校内要完成一定数量学生的招生（任务），其目的是促进教育平等化，使各初级中学的学生都有机会上好的高中。材料补充：指标生要比普通分低一些，录完普通生也是统招生之后再录指标生，每个学校有固定人数，会具体到班级，分学年指标生，和班级指标生，都是按分卡，分高的录取，也就是说如果你在这个临界点上，在一个成绩差的学校或班级会占优势，但指标生的条件是在校满两年。指标生可以简单地理解为定向招生，是指部分普通高中拿出部分招生计划分配到一定范围的学校招生，指标生名额将统一公示。指标生由教育局统一分配，因各地政策不同，分配方式可能略有差异，在校初级中学毕业生均可填报指标生志愿。指标生录取控制线一般控制在本校（分配该指标生的高中）统招生分数线下20分以内，如果在此控制线上不能完成指标生计划，则收回指标纳入统招生的计划。此外，有些考生和家长希望进入理想的学校，即使低于最低录取分数线也强烈要求进学校学习，对这种情况，学校也会考虑他们的需求，这部分学生也叫择校生。