在五指山。

海南热带海洋学院本科是在三亚，专科是在五指山，原名叫琼州学院。于1993年由海南省通什师范专科学校和海南省通什教育学院合并组建为琼州大学（专科）；2006年琼州大学升格为本科院校，更名为琼州学院，同年4月海南民族师范学校并入琼州学院；2009年学校主校区由五指山市搬迁至三亚市；2015年9月，更名为海南热带海洋学院。