1、车辆工程学院 汽车运用技术（“3+2”分段培养）、汽车电子技术、新能源汽车技术、汽车整形技术、汽车技术服务与营销、工程机械运用与维护。

2、公路与建筑学院 道路桥梁工程技术（“3+2”分段培养）、公路监理、土木工程检测技术、建筑工程技术、工程造价、城市轨道交通工程技术。

3、管理与信息学院 物流管理（“3+2”分段培养）、公路运输与管理、会计、电子商务、计算机网络技术、市场开发与营销、物联网应用技术、城市轨道交通运营管理。

4、机电工程学院 机械设计与制造、机电一体化技术、汽车制造与装配技术、数控技术。

5、航海学院 航海技术、轮机工程技术、船舶电子电气技术。 山东交通职业学院始建于1973年，其前身是昌潍地区交通局于1973年12月25日在寿光县城创建的昌潍地区交通技工学校。

1981年，更名为潍坊地区交通技工学校。

1982年10月，更名为山东省公路运输潍坊技工学校。 1987年6月，设立山东省潍坊汽车运输学校，与山东省公路运输潍坊技工学校合署办公，隶属山东省交通厅。

1989年6月，更名为山东省潍坊交通学校，9月，更名为山东省潍坊交通技工学校。 2000年5月，更名为山东省交通工程学校。

2002年7月，改建为山东交通职业学院。

2013年12月，原山东省交通运输学校整体并入。 目前，学校正全面实施山东省优质高职院校建设工程，按照学校“一个目标，四个全面”的战略布局和“稳定规模、优化结构、提高质量、突出特色、塑造品牌、坚守底线”的总体要求； 坚持“固本强基、重点突破、品牌引领”，以立德树人为根本，以服务发展为宗旨，以促进就业为导向，积极推进教育教学改革，努力创建办学特色鲜明、全国一流的高水平高职院校。