转录组数据库的意思是:对经过不同类型试剂(小分子化合物为主)处理的细胞系进行转录组层面的测序，分析这些试剂所造成的相对于正常细胞系的差异基因图谱。

并基于差异基因结果，提供一系列后续分析方案。而CMAP(CONNECTIVITY MAP)正是LINCS Center for Transcriptomics at the Broad Institute(cellular phenotype→转录表达水平)，使用L1000测序方法建立起来的数据库。