华南附属中学开设有数理化生、计算机、文史哲、外语、美术、音乐、体育七个方向的专业。

其中，数理化生专业注重培养学生的数理化基础和实验能力；计算机专业重点讲解程序设计和编程；文史哲专业重视培养学生的人文素质和思辨能力；外语专业注重英语语言能力和跨文化交际；美术专业着重培养学生的美术基础和绘画技能；音乐专业重视音乐理论和演奏技巧；体育专业注重提高学生的体力和运动技能。华南附属中学的专业设置旨在全面培养学生的多元素质和综合能力。