2001年-2013年，中山大学作为首席科学家单位承担国家973计划（包括国际重大科学计划）15项，主持国家863计划资助项目共18项，承担国家自然科学基金重点重大类项目58项，理工医科领域获省部级以上科技奖励47项，其中，7项国家自然科学奖二等奖、10项国家科技进步二等奖，17项研究分别获中华医学科学奖一、二、三等奖。
2006年至2013年，中山大学在人文社科领域承担国家社科基金重大项目12项，教育部哲学社会科学研究重大课题攻关项目10项，国家哲学社科基金项目重点及一般项目189项。
2011年，学校获教育部人文社会科学研究一般项目41项，立项数在全国高校并列*9。“十一五”以来，全校文科共获省部级以上成果奖励210项，其中，2006年获第四届全国高校人文社科成果奖16项，2007年获广东省2004-2005年度哲学社会科学优秀成果奖41项；2009年获高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）18项，广东省2006-2007年度哲学社会科学优秀成果奖43项；2011年获广东省2008-2009年度哲学社会科学优秀成果奖45项；2013年获得高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）15项，获广东省2010-2011年度哲学社会科学优秀成果奖57项。
