阜阳职业技术学院学校于1956年建校，1981年经安徽省人民政府批准为独立设置的成人高校阜阳教育学院。

1998年开始举办高等职业教育，是安徽省起步较早的两所高职院校之一。

2001年6月，更名为阜阳职业技术学院。

2009年，阜阳建筑学校并入。

2013年9月，阜阳卫生学校并入。学校现为国家百所骨干高职院校、安徽省首批示范性高等职业院校、安徽省首批校企合作示范典型学校、安徽省高等职业教育发展标杆校，是中央财政支持的产教融合实训基地项目建设学校，教育部现代学徒制、“1+X”证书制度试点单位，安徽省首批地方技能型高水平大学立项建设单位，安徽省唯一一所火箭军、战略支援部队定向培养士官生院校。