上海大学中外合资的分数相对较低可能有以下几个原因：

1. 教学质量不稳定：中外合资学校的教学质量可能受到两个合作方的影响，教学资源和师资力量可能不够稳定，导致教学质量的波动和不稳定性。

2. 课程设置和教学方法不适应：中外合资学校的课程设置和教学方法可能是针对两个合作方的需求进行设计的，可能没有很好地适应国内的高考和招生制度，导致学生在高考中的表现相对较差。

3. 学生质量参差不齐：中外合资学校的学生来源可能比较广泛，包括国内和国外的学生，学生的学术水平和学习能力可能存在差异，导致整体分数相对较低。需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况可能还与学校的具体情况和发展阶段有关。每个中外合资学校都有自己的特点和发展方向，所以分数的高低并不代表教育质量的好坏，还需要综合考虑其他因素。